Les missions du poste

Scienta Lab recherche une personne talentueuse et motivée pour construire et améliorer notre infrastructure de données. En tant que Biomedical Data Engineer, vous jouerez un rôle clé dans l'identification, le stockage, la documentation et l'accès à des bases de données multimodales liés aux maladies immuno-inflammatoires. Votre mission inclura le développement de solutions techniques pour assurer la qualité, l'accessibilité et l'utilisation des ensembles de données multimodales, permettant aux différentes équipes de l'entreprise de mener des recherches et des innovations impactantes.

Vous rejoindrez l'équipe Biomédicale et serez rattaché(e) directement au Directeur Scientifique (Chief Scientific Officer, CSO).

Principales Missions :

Sourcing de données : identifier des ensembles de données publics en immuno-inflammation, incluant des données cliniques et moléculaires, et développer des solutions techniques pour automatiser leur collecte et intégration.

Traitement des données : concevoir, développer et maintenir des pipelines bioinformatiques robustes pour automatiser la curation, le nettoyage et la préparation du portefeuille de données de Scienta Lab. Assurer l'intégrité et la fiabilité des données traitées pour les analyses en aval.

Annotation des données : mettre en œuvre et maintenir des annotations de haute qualité pour les ensembles de données, en garantissant leur exhaustivité, leur précision et leur conformité avec les normes internes.

Documentation des données : gérer et maintenir une documentation claire et détaillée pour tous les ensembles de données, y compris les métadonnées, la provenance et les directives d'utilisation. Veiller à ce que la documentation respecte les meilleures pratiques de l'industrie et facilite la reproductibilité.

Visualisation des données : créer des visualisations et réaliser des études de faisabilité pour évaluer les ensembles de données et appuyer les décisions stratégiques. Fournir des tableaux de bord intuitifs ou des outils permettant d'explorer les données et d'obtenir des informations exploitables.

Collaboration en codage : travailler en étroite collaboration avec l'équipe technique pour soutenir leurs efforts de modélisation des données, promouvoir les bonnes pratiques en ingénierie logicielle et assurer une intégration fluide des ensembles de données dans les flux analytiques.

Collaboration : collaborer étroitement avec les équipes business, scientifiques et de data science pour garantir que les ensembles de données soient facilement accessibles, bien documentés et conformes aux normes de qualité. Agir comme point de contact pour les demandes concernant les ensembles de données et l'assistance technique.


  • Expérience : au moins 4 ans d'expérience en bioinformatique, biologie computationnelle ou dans un domaine connexe.
  • Expertise en Données : solide compréhension des données omiques (ex : transcriptomique, protéomique) et des données cliniques.
  • Interprétation des Données : capacité démontrée à créer des visualisations de données efficaces et à analyser des ensembles de données complexes.
  • Compétences Techniques :
    • Maîtrise des outils, bibliothèques et bases de données bioinformatiques pertinents pour l'analyse des données omiques (ex : Bioconductor, bases de données NCBI).
    • Expérience pratique dans le développement et l'optimisation de pipelines bioinformatiques à l'aide de systèmes de gestion de flux de travaux (ex : Snakemake, Nextflow).
    • Solides compétences en programmation en Python, avec une bonne maîtrise des meilleures pratiques de codage.
  • Compétences Linguistiques : maîtrise professionnelle complète de l'anglais.

Scienta Lab est une start-up deeptech utilisant l'intelligence artificielle pour transformer le processus de découverte et de développement de médicaments en immunologie et inflammation.

Scienta Lab développe un modèle de fondation multimodal pour soutenir la recherche translationnelle en immunologie.

Scienta Lab collabore avec des institutions académiques de premier plan, des biotechs et des entreprises pharmaceutiques à travers le monde pour développer son modèle. L'entreprise dispose d'une expertise scientifique reconnue sur la médecine de précision en l'immunologie, avec des publications scientifiques dans des revues médicales et des conférences de premier rang.

Scienta Lab est basée à Biolabs Hôtel-Dieu. Rejoignez-nous et prenez part à notre aventure passionnante pour faire progresser la recherche médicale en immunologie de précision !

Lieu : Paris
Contrat : CDI
Télétravail : Télétravail partiel
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