Postée il y a 20 heures
Le candidat ou la candidate développera des méthodes analytiques de pointe pour l’analyse protéomique sur cellule unique avec une dimension spatiale. Il ou elle développera un protocole de préparation des échantillons adapté à des échantillons obtenus par micro-dissection laser sur un système de microfluidique ainsi que des méthodes d’analyses LC-MS/MS ultra-sensibles et à haut débit.
Activités
- Développer des protocoles de préparation d’échantillons obtenus par microdissection laser sur un instrument microfluidique de type CellenOne.
- Développer des méthodes d’acquisitions nanoLC-MS/MS ultra-sensibles, compatibles avec l’analyse du contenu protéique de cellules uniques sur des couplages nanoLC-MS/MS de type Q-TOF (TimsTOF Ultra de Bruker) et Orbitrap-Astral (Thermo).
- Evaluer des systèmes de nano-chromatographies innovants pour améliorer la sensibilité de l’analyse tout en augmentant le débit des analyses
- Optimiser les méthodes de traitement des données MS/MS et des analyses statistiques pour des données single cell, en utilisant des outils innovants basés sur des algorithmes d’intelligence artificielle;
- Présenter et valoriser les résultats obtenus ;
- Assurer la traçabilité des analyses dans le cadre de la démarche qualité du LSMBO (environnement ISO9001).
Compétences
Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires
- Expertise en chimie bioanalytique, spectrométrie de masse, analyse protéomique. Maîtrise des outils de traitement bioinformatique des données MS/MS.
Savoir-faire opérationnels
- Maîtriser les stratégies d’analyse protéomique, en particulier pour l’analyse ultra-sensible;
- Maîtriser les techniques de chromatographie liquide (chromatographie sur phase inverse) et de spectrométrie de masse en tandem;
- Maîtriser les outils informatiques de traitement des données LC-MS/MS;
Maîtriser les stratégies d’analyse protéomique, en particulier pour l’analyse ultra-sensible;
- Maîtriser les techniques de chromatographie liquide (chromatographie sur phase inverse) et de spectrométrie de masse en tandem;
- Maîtriser les outils informatiques de traitement des données LC-MS/MS;
- Des connaissances en microfluidique et tri cellulaire seraient un atout
- Des connaissances dans des langages de programmation tels que Python et/ou R seraient également un atout
- Gérer son travail dans un environnement certifié ISO9001 ;
- Communiquer et assurer les échanges scientifiques avec les collaborateurs du projet;
- Travailler en équipe et en collaboration dans un contexte pluridisciplinaire ;
- Maîtriser l'anglais écrit et oral (de niveau B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues) pour la présentation des résultats lors de congrès et la rédaction de publications.
Contexte de travail
L'Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l'Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l'instrumentation scientifique.
L'IPHC est structuré en 4 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.
Le candidat ou la candidate retenu(e) rejoindra l'équipe LSMBO (Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique) de l'IPHC, où il ou elle bénéficiera de l'ensemble du parc instrumental de pointe (LC-MS/MS) pour l'analyse protéomique. Le projet sera mené en collaboration avec l'équipe « Dynamique Membranaire & Virus » dirigée par le Dr. R. Gaudin (IRIM, Montpellier) et les sites toulousain et grenoblois de l'infrastructure nationale de protéomique ProFI (UAR2048).
Le candidat ou la candidate bénéficiera de l'accès à un restaurant administratif, d'une prise en charge partielle des titres de transport, d'un comité d'entreprise, la possibilité de télétravailler pour une partie des activités et de formations pour l'adaptation au poste de travail.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
L'Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l'Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l'instrumentation scientifique.
L'IPHC est structuré en 4 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.
Le candidat ou la candidate retenu(e) rejoindra l'équipe LSMBO (Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique) de l'IPHC, où il ou elle bénéficiera de l'ensemble du parc instrumental de pointe (LC-MS/MS) pour l'analyse protéomique. Le projet sera mené en collaboration avec l'équipe « Dynamique Membranaire & Virus » dirigée par le Dr. R. Gaudin (IRIM, Montpellier) et les sites toulousain et grenoblois de l'infrastructure nationale de protéomique ProFI (UAR2048).
Le candidat ou la candidate bénéficiera de l'accès à un restaurant administratif, d'une prise en charge partielle des titres de transport, d'un comité d'entreprise, la possibilité de télétravailler pour une partie des activités et de formations pour l'adaptation au poste de travail.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
Travail dans un environnement certifié ISO 9001
Travail dans un environnement certifié ISO 9001