iIngénieur en expérimentation et instrumentation bologiques (réf. BFASU2) F/H

Les missions du poste

Fonctions : A2A42 – Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques

Emploi-type : Ingénieur en analyses métabolomiques et protéomiques par spectrométrie de masse

Catégorie : A

Corps : Ingénieur d’études

BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement

CDD de 1 an, renouvelable

Mission : Développer, adapter et mettre en œuvre des approches métabolomiques et protéomiques par spectrométrie de masse.

Activités principales :

• Conseiller les utilisateurs, choisir, adapter (et développer si nécessaire) les méthodes d’analyse métabolomiques et protéomiques en fonction des objectifs des projets
• Mettre en œuvre expérimentalement la préparation des échantillons et réaliser les analyses MS (métabolomiqueset protéomiques)
• Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et en garantir le suivi et la qualité
• Assurer un reporting régulier des projets et communiquer les résultats sous forme de rapports d'analyse
• Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales et de publications
• Assurer une veille scientifique et technologique dans ses domaines d'activité
• Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité
• Assurer le suivi métrologique des équipements du service
• Gérer et organiser les moyens techniques et les stocks des réactifs et consommables
• Participer aux tâches collectives au sein de l’équipe ainsi qu’à la formation des stagiaires

Conduite de projets : OUI

Encadrement : NON

Exposition aux risques professionnels : OUI

Risques biologiques et chimiques faibles (laboratoire L1)

Connaissances transversales requises :

• Organisation et fonctionnement de la recherche et de l’enseignement supérieur en France
• Réglementation applicable à son domaine d’activité professionnelle
• Connaissance théorique approfondie des techniques de spectrométrie de masse ESI-MS et MALDI-TOF MS
• Connaissance théorique approfondie des méthodes de séparation par chromatographie liquide
• Connaissance théorique approfondie des méthodes de préparation et d’analyse par MS des échantillons de type métabolites/petites molécules
• Connaissance approfondie des méthodes et outils relatives aux traitements bioinformatiques et statistiques des données en métabolomique
• Connaissance théorique des méthodes de préparation des échantillons de type protéines et de leur analyse par des approches protéomiques de type bottom-up…

Savoir-faire :

• Bonne maîtrise pratique des méthodes de préparation des échantillons (métabolites/petites molécules) en vue de leur analyse par spectrométrie de masse
• Bonne maîtrise technique de la chromatographie UHPLC
• Bonne maîtrise technique des spectromètres de masse haute résolution (de préférence de type Orbitrap) et des méthodes d’acquisition DDA et DIA
• Concevoir et optimiser des expériences d’analyse MS en mode données dépendantes (DDA) et indépendantes (DIA)
• Bonne maîtrise pratique des méthodes et logiciels bio-informatiques relatifs à l’analyse quantitative et structurale (bases de données, réseaux moléculaires) des petites molécules et métabolites par spectrométrie de masse
• Bonne maîtrise pratique des méthodes et logiciels relatifs au traitement statistique de jeux de données de métabolomique
• Rédiger des documents scientifiques et des rapports d’analyse
• Respecter les principes et règles d’hygiène et de sécurité

Savoir-faire Transversaux :

• Bonne capacité organisationnelle (organisation expérimentale, gestion des délais)
• Bonne capacité d’initiative et d’adaptation
• Bonnes qualités rédactionnelles et de présentation orale
• Maîtrise à l’écrit et à l’oral des langues française et anglaise (niveau B2 ou plus)

Savoir-être :

• Bonnes capacités relationnelles et sens du travail dans un environnement multidisciplinaire
• Bonne capacité de raisonnement et d’analyse
• Curiosité, intérêt pour le développement technologique et aptitude à se former aux nouvelles techniques

Sorbonne Université (SU) est une université pluridisciplinaire et de recherche intensive. Poursuivant la tradition humaniste de la Sorbonne, elle s’attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche à ses étudiantes et étudiants et à la société tout entière.

Déployant ses formations auprès de 54 000 étudiantes et étudiants dont 4 700 doctorantes et doctorants et 10 200 étudiantes et étudiants étrangers, elle emploie 6 300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs et 4 900 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé. Son budget est de 670 M€.

SU, principalement située au cœur de Paris, dispose d’un potentiel de premier plan et étend sa présence dans plus de vingt sites en Ile-de-France et en régions.

SU présente une organisation originale en trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » qui disposent d’une importante autonomie de mise en œuvre de la stratégie de l’université dans leur périmètre sur la base d’un contrat d’objectifs et de moyens. La gouvernance universitaire se consacre prioritairement à la promotion de la stratégie de l’université, au pilotage, au développement des partenariats et à la diversification des ressources.

Ce poste est à pourvoir au sein des Directions Interfacultaires • http://www.sorbonne-universite.fr

Ce poste est à pourvoir au sein de :

L’Unité Mixte de Service Biofonderie de l’Alliance Sorbonne Université (BFASU), sous la tutelle de Sorbonne Université, de l’Université de Technologie de Compiègne et du CNRS (UAR2037), créée fin 2023, a pour mission de mettre en place une offre de services technologiques, de partenariats et de formation de haut niveau en bio-ingénierie à destination des formations universitaires, des laboratoires académiques et des entreprises du secteur, avec l’ambition affichée de structurer la filière de l’ingénierie du vivant depuis son niveau fondamental jusqu’à ses applications technologiques. La BFASU est la première biofonderie académique en France, une plateforme robotisée de biologie de synthèse. Cette infrastructure d’excellence donne accès aux technologies de pointe nécessaires pour accélérer la recherche fondamentale, la recherche appliquée et translationnelle, le développement industriel et l’innovation. Cette unité multi-tutelles développe des activités partenariales académiques et industrielles, favorise l’émergence de projets d’innovation ainsi que la prématuration et la maturation de startups. Elle développe également des activités de valorisation, de marketing et anime un réseau de partenaires.

Localisation : Campus Pierre et Marie Curie, Bâtiment B – 2ème étage, BC28, 4 place Jussieu 75005 Paris